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短串联重复序列(short tsndem repeats ,STRs)是广泛存在于人类基因组中的一类具有长度多态性的DNA序列。它们一般由2—6 个碱基构成一个核心序列,核心序列在长度上呈串联重复排列,主要由核心序列拷贝数目的变化产生长度多态性,如D5S818:5′GGGTGATTTTCC TTTTGGT(AGAT)7-14TGTGGCTATGATTGGAATCA3′。据gene bank数据库的资料统计,23对染色体上至少分布着7901个STR基因座,每对染色体上的STR基因座均超过了100个,平均每15kb就分布着1个STR基因座,现有的STR基因座覆盖长度达4000cm,平均间距0.7cm。

由于STR具有高度多态性、高杂合度、高信息含量、检测简便、快捷等优点,很快即应用于遗传连锁图的构建、疾病相关基因的定位、人类学及法医学等研究领域,成为目前应用最广泛、研究较深入的遗传标记之一,也成为现今亲权鉴定、基因数据库构建的主要手段。

目前实验室鉴定常使用的STR 基因座有:TH01、FGA、TPOX、VWA、CSF1PO、D21S11、D3S1358、D7S820、D8S1179、D13S317、D16S539、D18S51和D5S818。STR分型具有很高的灵敏度和良好的重复性,分型结果稳定可靠。因此,STR技术有更高的非父排除率和个人识别几率。STR位点的总识别率为0.9999 9999 9999 9935,累计非父排除为99.999 %,在亲子鉴定中已达到很高的水平,因此被称为“第二代DNA 指纹”。STR位点在人类基因组中广泛分布, 具有丰富的多态位点资源, 而且扩增STR基因座仅需要少量模板DNA。联合使用多个STR位点,可满足各种需要。

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